如果已经补办了高考档案，但又找到了原件，建议按照以下步骤处理：
1. 确认找到的原件是否与补办的高考档案内容一致。如果不一致，可能是原件丢失或者被误置，需要再次进行补办。
2. 如果确认找到的原件与补办的高考档案内容一致，可以将其作为备份保存。但是，建议不要将原件再次提交给高考档案管理部门，以免造成不必要的麻烦。
3. 保留复印件或者扫描件作为使用参考，正常进行相关事宜的处理。总之，找到高考档案原件是一件好事，但是需要根据实际情况进行处理，确保使用正确的档案版本，避免造成不必要的麻烦。
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